Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD33

MRPL47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL47Q9HD33 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPL47Q9HD33 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL47Q9HD33 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL47Q9HD33 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL47Q9HD33 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL47Q9HD33 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL47Q9HD33 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL47Q9HD33 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL47Q9HD33 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL47Q9HD33 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL47Q9HD33 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL47Q9HD33 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL47Q9HD33 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL47Q9HD33 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MRPL47Q9HD33 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPL47Q9HD33 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPL47Q9HD33 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPL47Q9HD33 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPL47Q9HD33 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL47Q9HD33 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL47Q9HD33 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL47Q9HD33 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL47Q9HD33 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL47Q9HD33 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL47Q9HD33 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL47Q9HD33 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL47Q9HD33 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL47Q9HD33 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL47Q9HD33 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL47Q9HD33 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL47Q9HD33 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL47Q9HD33 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL47Q9HD33 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL47Q9HD33 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL47Q9HD33 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL47Q9HD33 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL47Q9HD33 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL47Q9HD33 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPL47Q9HD33 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPL47Q9HD33 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPL47Q9HD33 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPL47Q9HD33 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPL47Q9HD33 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPL47Q9HD33 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPL47Q9HD33 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPL47Q9HD33 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPL47Q9HD33 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MRPL47Q9HD33 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MRPL47Q9HD33 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MRPL47Q9HD33 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MRPL47Q9HD33 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MRPL47Q9HD33 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRPL47Q9HD33 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRPL47Q9HD33 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRPL47Q9HD33 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRPL47Q9HD33 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRPL47Q9HD33 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRPL47Q9HD33 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms