Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCX3

ZNF304, Zinc finger protein 304, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF304Q9HCX3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF304Q9HCX3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF304Q9HCX3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms