Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLXNA4Q9HCM2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLXNA4Q9HCM2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLXNA4Q9HCM2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLXNA4Q9HCM2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLXNA4Q9HCM2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLXNA4Q9HCM2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLXNA4Q9HCM2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLXNA4Q9HCM2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLXNA4Q9HCM2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLXNA4Q9HCM2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLXNA4Q9HCM2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLXNA4Q9HCM2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLXNA4Q9HCM2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PLXNA4Q9HCM2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLXNA4Q9HCM2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PLXNA4Q9HCM2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLXNA4Q9HCM2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNA4Q9HCM2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNA4Q9HCM2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNA4Q9HCM2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNA4Q9HCM2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNA4Q9HCM2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNA4Q9HCM2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNA4Q9HCM2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNA4Q9HCM2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNA4Q9HCM2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNA4Q9HCM2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNA4Q9HCM2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNA4Q9HCM2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNA4Q9HCM2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNA4Q9HCM2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNA4Q9HCM2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNA4Q9HCM2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNA4Q9HCM2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNA4Q9HCM2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXNA4Q9HCM2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNA4Q9HCM2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNA4Q9HCM2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNA4Q9HCM2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNA4Q9HCM2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNA4Q9HCM2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNA4Q9HCM2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNA4Q9HCM2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNA4Q9HCM2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNA4Q9HCM2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNA4Q9HCM2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLXNA4Q9HCM2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLXNA4Q9HCM2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLXNA4Q9HCM2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLXNA4Q9HCM2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLXNA4Q9HCM2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLXNA4Q9HCM2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.7 ms