Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ2

LRRC4C, Leucine-rich repeat-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4CQ9HCJ2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC4CQ9HCJ2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC4CQ9HCJ2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC4CQ9HCJ2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC4CQ9HCJ2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC4CQ9HCJ2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC4CQ9HCJ2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC4CQ9HCJ2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC4CQ9HCJ2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC4CQ9HCJ2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC4CQ9HCJ2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC4CQ9HCJ2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC4CQ9HCJ2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC4CQ9HCJ2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC4CQ9HCJ2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC4CQ9HCJ2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC4CQ9HCJ2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC4CQ9HCJ2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC4CQ9HCJ2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC4CQ9HCJ2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRC4CQ9HCJ2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRC4CQ9HCJ2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC4CQ9HCJ2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC4CQ9HCJ2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC4CQ9HCJ2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC4CQ9HCJ2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC4CQ9HCJ2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC4CQ9HCJ2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC4CQ9HCJ2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC4CQ9HCJ2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC4CQ9HCJ2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC4CQ9HCJ2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC4CQ9HCJ2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC4CQ9HCJ2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC4CQ9HCJ2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC4CQ9HCJ2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC4CQ9HCJ2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC4CQ9HCJ2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC4CQ9HCJ2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC4CQ9HCJ2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC4CQ9HCJ2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC4CQ9HCJ2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC4CQ9HCJ2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4CQ9HCJ2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4CQ9HCJ2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4CQ9HCJ2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4CQ9HCJ2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4CQ9HCJ2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4CQ9HCJ2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4CQ9HCJ2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4CQ9HCJ2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4CQ9HCJ2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4CQ9HCJ2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4CQ9HCJ2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC4CQ9HCJ2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC4CQ9HCJ2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC4CQ9HCJ2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC4CQ9HCJ2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC4CQ9HCJ2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC4CQ9HCJ2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC4CQ9HCJ2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC4CQ9HCJ2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC4CQ9HCJ2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC4CQ9HCJ2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC4CQ9HCJ2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC4CQ9HCJ2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC4CQ9HCJ2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC4CQ9HCJ2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC4CQ9HCJ2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC4CQ9HCJ2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC4CQ9HCJ2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC4CQ9HCJ2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC4CQ9HCJ2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC4CQ9HCJ2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC4CQ9HCJ2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC4CQ9HCJ2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC4CQ9HCJ2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC4CQ9HCJ2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC4CQ9HCJ2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC4CQ9HCJ2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC4CQ9HCJ2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC4CQ9HCJ2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC4CQ9HCJ2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC4CQ9HCJ2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC4CQ9HCJ2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC4CQ9HCJ2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC4CQ9HCJ2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC4CQ9HCJ2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC4CQ9HCJ2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC4CQ9HCJ2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC4CQ9HCJ2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC4CQ9HCJ2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC4CQ9HCJ2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC4CQ9HCJ2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC4CQ9HCJ2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC4CQ9HCJ2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC4CQ9HCJ2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC4CQ9HCJ2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC4CQ9HCJ2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC4CQ9HCJ2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms