Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB58

SP110, Sp110 nuclear body protein, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP110Q9HB58 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP110Q9HB58 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP110Q9HB58 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP110Q9HB58 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP110Q9HB58 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP110Q9HB58 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP110Q9HB58 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP110Q9HB58 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP110Q9HB58 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP110Q9HB58 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP110Q9HB58 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP110Q9HB58 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP110Q9HB58 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP110Q9HB58 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP110Q9HB58 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP110Q9HB58 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP110Q9HB58 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP110Q9HB58 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP110Q9HB58 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP110Q9HB58 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SP110Q9HB58 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SP110Q9HB58 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SP110Q9HB58 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SP110Q9HB58 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SP110Q9HB58 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SP110Q9HB58 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SP110Q9HB58 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SP110Q9HB58 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SP110Q9HB58 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SP110Q9HB58 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SP110Q9HB58 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SP110Q9HB58 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SP110Q9HB58 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SP110Q9HB58 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP110Q9HB58 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP110Q9HB58 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP110Q9HB58 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP110Q9HB58 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP110Q9HB58 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP110Q9HB58 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP110Q9HB58 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms