Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q4

NHEJ1, Non-homologous end-joining factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHEJ1Q9H9Q4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NHEJ1Q9H9Q4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms