Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6L5

RETREG1, Reticulophagy regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG1Q9H6L5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RETREG1Q9H6L5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RETREG1Q9H6L5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RETREG1Q9H6L5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RETREG1Q9H6L5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RETREG1Q9H6L5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RETREG1Q9H6L5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RETREG1Q9H6L5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RETREG1Q9H6L5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RETREG1Q9H6L5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RETREG1Q9H6L5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RETREG1Q9H6L5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms