Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6K4

OPA3, Optic atrophy 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPA3Q9H6K4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPA3Q9H6K4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPA3Q9H6K4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPA3Q9H6K4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPA3Q9H6K4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPA3Q9H6K4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPA3Q9H6K4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPA3Q9H6K4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPA3Q9H6K4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPA3Q9H6K4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
OPA3Q9H6K4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPA3Q9H6K4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OPA3Q9H6K4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OPA3Q9H6K4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OPA3Q9H6K4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
OPA3Q9H6K4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OPA3Q9H6K4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OPA3Q9H6K4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OPA3Q9H6K4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OPA3Q9H6K4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OPA3Q9H6K4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OPA3Q9H6K4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OPA3Q9H6K4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OPA3Q9H6K4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OPA3Q9H6K4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OPA3Q9H6K4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OPA3Q9H6K4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OPA3Q9H6K4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OPA3Q9H6K4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OPA3Q9H6K4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OPA3Q9H6K4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OPA3Q9H6K4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
OPA3Q9H6K4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OPA3Q9H6K4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OPA3Q9H6K4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OPA3Q9H6K4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OPA3Q9H6K4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
OPA3Q9H6K4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
OPA3Q9H6K4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms