Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W6

MRPL46, 39S ribosomal protein L46, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL46Q9H2W6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL46Q9H2W6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL46Q9H2W6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL46Q9H2W6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL46Q9H2W6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL46Q9H2W6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL46Q9H2W6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL46Q9H2W6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL46Q9H2W6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL46Q9H2W6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL46Q9H2W6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL46Q9H2W6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL46Q9H2W6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL46Q9H2W6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL46Q9H2W6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL46Q9H2W6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL46Q9H2W6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL46Q9H2W6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL46Q9H2W6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL46Q9H2W6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL46Q9H2W6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL46Q9H2W6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL46Q9H2W6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL46Q9H2W6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL46Q9H2W6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL46Q9H2W6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL46Q9H2W6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL46Q9H2W6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL46Q9H2W6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL46Q9H2W6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL46Q9H2W6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL46Q9H2W6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL46Q9H2W6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL46Q9H2W6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL46Q9H2W6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL46Q9H2W6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL46Q9H2W6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL46Q9H2W6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
MRPL46Q9H2W6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MRPL46Q9H2W6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MRPL46Q9H2W6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MRPL46Q9H2W6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL46Q9H2W6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MRPL46Q9H2W6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms