Protein–RNA interactions for Protein: Q9H195

MUC3B, Mucin-3B (Fragments), humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3BQ9H195 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MUC3BQ9H195 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MUC3BQ9H195 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MUC3BQ9H195 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MUC3BQ9H195 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MUC3BQ9H195 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MUC3BQ9H195 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MUC3BQ9H195 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MUC3BQ9H195 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MUC3BQ9H195 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MUC3BQ9H195 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MUC3BQ9H195 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MUC3BQ9H195 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MUC3BQ9H195 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MUC3BQ9H195 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MUC3BQ9H195 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MUC3BQ9H195 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MUC3BQ9H195 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MUC3BQ9H195 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MUC3BQ9H195 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MUC3BQ9H195 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MUC3BQ9H195 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MUC3BQ9H195 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MUC3BQ9H195 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MUC3BQ9H195 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MUC3BQ9H195 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MUC3BQ9H195 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MUC3BQ9H195 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MUC3BQ9H195 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MUC3BQ9H195 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MUC3BQ9H195 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MUC3BQ9H195 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MUC3BQ9H195 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MUC3BQ9H195 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MUC3BQ9H195 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MUC3BQ9H195 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MUC3BQ9H195 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MUC3BQ9H195 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MUC3BQ9H195 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MUC3BQ9H195 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MUC3BQ9H195 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms