Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP44Q9H0E7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP44Q9H0E7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP44Q9H0E7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP44Q9H0E7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP44Q9H0E7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP44Q9H0E7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP44Q9H0E7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP44Q9H0E7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP44Q9H0E7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP44Q9H0E7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP44Q9H0E7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP44Q9H0E7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP44Q9H0E7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP44Q9H0E7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
USP44Q9H0E7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
USP44Q9H0E7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP44Q9H0E7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP44Q9H0E7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
USP44Q9H0E7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP44Q9H0E7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP44Q9H0E7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
USP44Q9H0E7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP44Q9H0E7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP44Q9H0E7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP44Q9H0E7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP44Q9H0E7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP44Q9H0E7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP44Q9H0E7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP44Q9H0E7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP44Q9H0E7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP44Q9H0E7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP44Q9H0E7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP44Q9H0E7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP44Q9H0E7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP44Q9H0E7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP44Q9H0E7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP44Q9H0E7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP44Q9H0E7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP44Q9H0E7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP44Q9H0E7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP44Q9H0E7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP44Q9H0E7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP44Q9H0E7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP44Q9H0E7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP44Q9H0E7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP44Q9H0E7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP44Q9H0E7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP44Q9H0E7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP44Q9H0E7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP44Q9H0E7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP44Q9H0E7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP44Q9H0E7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP44Q9H0E7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP44Q9H0E7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP44Q9H0E7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP44Q9H0E7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP44Q9H0E7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP44Q9H0E7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP44Q9H0E7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP44Q9H0E7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP44Q9H0E7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP44Q9H0E7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP44Q9H0E7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP44Q9H0E7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP44Q9H0E7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP44Q9H0E7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP44Q9H0E7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP44Q9H0E7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP44Q9H0E7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
USP44Q9H0E7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP44Q9H0E7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP44Q9H0E7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP44Q9H0E7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP44Q9H0E7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
USP44Q9H0E7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP44Q9H0E7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP44Q9H0E7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP44Q9H0E7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP44Q9H0E7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP44Q9H0E7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
USP44Q9H0E7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
USP44Q9H0E7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP44Q9H0E7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP44Q9H0E7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP44Q9H0E7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP44Q9H0E7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
USP44Q9H0E7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
USP44Q9H0E7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP44Q9H0E7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP44Q9H0E7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP44Q9H0E7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP44Q9H0E7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP44Q9H0E7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
USP44Q9H0E7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP44Q9H0E7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP44Q9H0E7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP44Q9H0E7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP44Q9H0E7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP44Q9H0E7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.3 ms