Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC39A8Q9C0K1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A8Q9C0K1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A8Q9C0K1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A8Q9C0K1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A8Q9C0K1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A8Q9C0K1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A8Q9C0K1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A8Q9C0K1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC39A8Q9C0K1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC39A8Q9C0K1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC39A8Q9C0K1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC39A8Q9C0K1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC39A8Q9C0K1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC39A8Q9C0K1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC39A8Q9C0K1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC39A8Q9C0K1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC39A8Q9C0K1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC39A8Q9C0K1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC39A8Q9C0K1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC39A8Q9C0K1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A8Q9C0K1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A8Q9C0K1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A8Q9C0K1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A8Q9C0K1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A8Q9C0K1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A8Q9C0K1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A8Q9C0K1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A8Q9C0K1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A8Q9C0K1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A8Q9C0K1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A8Q9C0K1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A8Q9C0K1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A8Q9C0K1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A8Q9C0K1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A8Q9C0K1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A8Q9C0K1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A8Q9C0K1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A8Q9C0K1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A8Q9C0K1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms