Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM6Q9C030 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM6Q9C030 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM6Q9C030 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM6Q9C030 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM6Q9C030 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM6Q9C030 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM6Q9C030 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM6Q9C030 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM6Q9C030 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM6Q9C030 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM6Q9C030 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM6Q9C030 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM6Q9C030 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM6Q9C030 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM6Q9C030 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM6Q9C030 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM6Q9C030 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM6Q9C030 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM6Q9C030 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM6Q9C030 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM6Q9C030 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM6Q9C030 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM6Q9C030 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM6Q9C030 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM6Q9C030 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM6Q9C030 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM6Q9C030 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM6Q9C030 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM6Q9C030 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM6Q9C030 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM6Q9C030 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM6Q9C030 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM6Q9C030 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM6Q9C030 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM6Q9C030 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM6Q9C030 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM6Q9C030 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM6Q9C030 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM6Q9C030 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM6Q9C030 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM6Q9C030 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms