Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EDEM3Q9BZQ6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EDEM3Q9BZQ6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
EDEM3Q9BZQ6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EDEM3Q9BZQ6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EDEM3Q9BZQ6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EDEM3Q9BZQ6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EDEM3Q9BZQ6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EDEM3Q9BZQ6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EDEM3Q9BZQ6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EDEM3Q9BZQ6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EDEM3Q9BZQ6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
EDEM3Q9BZQ6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
EDEM3Q9BZQ6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EDEM3Q9BZQ6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EDEM3Q9BZQ6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EDEM3Q9BZQ6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EDEM3Q9BZQ6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EDEM3Q9BZQ6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EDEM3Q9BZQ6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EDEM3Q9BZQ6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EDEM3Q9BZQ6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EDEM3Q9BZQ6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EDEM3Q9BZQ6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EDEM3Q9BZQ6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
EDEM3Q9BZQ6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDEM3Q9BZQ6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDEM3Q9BZQ6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDEM3Q9BZQ6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDEM3Q9BZQ6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDEM3Q9BZQ6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDEM3Q9BZQ6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDEM3Q9BZQ6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EDEM3Q9BZQ6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EDEM3Q9BZQ6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EDEM3Q9BZQ6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EDEM3Q9BZQ6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
EDEM3Q9BZQ6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EDEM3Q9BZQ6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EDEM3Q9BZQ6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EDEM3Q9BZQ6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
EDEM3Q9BZQ6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EDEM3Q9BZQ6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EDEM3Q9BZQ6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EDEM3Q9BZQ6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EDEM3Q9BZQ6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EDEM3Q9BZQ6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EDEM3Q9BZQ6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EDEM3Q9BZQ6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EDEM3Q9BZQ6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
EDEM3Q9BZQ6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EDEM3Q9BZQ6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EDEM3Q9BZQ6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EDEM3Q9BZQ6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDEM3Q9BZQ6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDEM3Q9BZQ6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDEM3Q9BZQ6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDEM3Q9BZQ6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDEM3Q9BZQ6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDEM3Q9BZQ6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDEM3Q9BZQ6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDEM3Q9BZQ6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDEM3Q9BZQ6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDEM3Q9BZQ6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDEM3Q9BZQ6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDEM3Q9BZQ6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDEM3Q9BZQ6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDEM3Q9BZQ6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDEM3Q9BZQ6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDEM3Q9BZQ6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDEM3Q9BZQ6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDEM3Q9BZQ6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDEM3Q9BZQ6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDEM3Q9BZQ6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDEM3Q9BZQ6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
EDEM3Q9BZQ6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDEM3Q9BZQ6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDEM3Q9BZQ6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDEM3Q9BZQ6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms