Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BCO2Q9BYV7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BCO2Q9BYV7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BCO2Q9BYV7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BCO2Q9BYV7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BCO2Q9BYV7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BCO2Q9BYV7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BCO2Q9BYV7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BCO2Q9BYV7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BCO2Q9BYV7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BCO2Q9BYV7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BCO2Q9BYV7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BCO2Q9BYV7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BCO2Q9BYV7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BCO2Q9BYV7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BCO2Q9BYV7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BCO2Q9BYV7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BCO2Q9BYV7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCO2Q9BYV7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCO2Q9BYV7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCO2Q9BYV7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCO2Q9BYV7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCO2Q9BYV7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCO2Q9BYV7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCO2Q9BYV7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCO2Q9BYV7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCO2Q9BYV7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCO2Q9BYV7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCO2Q9BYV7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCO2Q9BYV7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BCO2Q9BYV7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BCO2Q9BYV7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BCO2Q9BYV7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BCO2Q9BYV7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BCO2Q9BYV7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BCO2Q9BYV7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
BCO2Q9BYV7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BCO2Q9BYV7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
BCO2Q9BYV7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
BCO2Q9BYV7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BCO2Q9BYV7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BCO2Q9BYV7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BCO2Q9BYV7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BCO2Q9BYV7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BCO2Q9BYV7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BCO2Q9BYV7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BCO2Q9BYV7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BCO2Q9BYV7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BCO2Q9BYV7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BCO2Q9BYV7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BCO2Q9BYV7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BCO2Q9BYV7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCO2Q9BYV7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCO2Q9BYV7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCO2Q9BYV7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCO2Q9BYV7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms