Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM55Q9BYV6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM55Q9BYV6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM55Q9BYV6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM55Q9BYV6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM55Q9BYV6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM55Q9BYV6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM55Q9BYV6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM55Q9BYV6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM55Q9BYV6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM55Q9BYV6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM55Q9BYV6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM55Q9BYV6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM55Q9BYV6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM55Q9BYV6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM55Q9BYV6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM55Q9BYV6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM55Q9BYV6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM55Q9BYV6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM55Q9BYV6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM55Q9BYV6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM55Q9BYV6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM55Q9BYV6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM55Q9BYV6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM55Q9BYV6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM55Q9BYV6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms