Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC2Q9BYS8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC2Q9BYS8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC2Q9BYS8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC2Q9BYS8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC2Q9BYS8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC2Q9BYS8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC2Q9BYS8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LRRC2Q9BYS8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC2Q9BYS8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC2Q9BYS8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC2Q9BYS8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC2Q9BYS8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LRRC2Q9BYS8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC2Q9BYS8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC2Q9BYS8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC2Q9BYS8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC2Q9BYS8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC2Q9BYS8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC2Q9BYS8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC2Q9BYS8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC2Q9BYS8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC2Q9BYS8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC2Q9BYS8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC2Q9BYS8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC2Q9BYS8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC2Q9BYS8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC2Q9BYS8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC2Q9BYS8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC2Q9BYS8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC2Q9BYS8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC2Q9BYS8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC2Q9BYS8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC2Q9BYS8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC2Q9BYS8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRRC2Q9BYS8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC2Q9BYS8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC2Q9BYS8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC2Q9BYS8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC2Q9BYS8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC2Q9BYS8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC2Q9BYS8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC2Q9BYS8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC2Q9BYS8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC2Q9BYS8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC2Q9BYS8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC2Q9BYS8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC2Q9BYS8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC2Q9BYS8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC2Q9BYS8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC2Q9BYS8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC2Q9BYS8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC2Q9BYS8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC2Q9BYS8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC2Q9BYS8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC2Q9BYS8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC2Q9BYS8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC2Q9BYS8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC2Q9BYS8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC2Q9BYS8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms