Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC8Q9BY41 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC8Q9BY41 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms