Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC46A2Q9BY10 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC46A2Q9BY10 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC46A2Q9BY10 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC46A2Q9BY10 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC46A2Q9BY10 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC46A2Q9BY10 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC46A2Q9BY10 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC46A2Q9BY10 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC46A2Q9BY10 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC46A2Q9BY10 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC46A2Q9BY10 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC46A2Q9BY10 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC46A2Q9BY10 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC46A2Q9BY10 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC46A2Q9BY10 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC46A2Q9BY10 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC46A2Q9BY10 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC46A2Q9BY10 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC46A2Q9BY10 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC46A2Q9BY10 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC46A2Q9BY10 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC46A2Q9BY10 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC46A2Q9BY10 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC46A2Q9BY10 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC46A2Q9BY10 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC46A2Q9BY10 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC46A2Q9BY10 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC46A2Q9BY10 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC46A2Q9BY10 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC46A2Q9BY10 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC46A2Q9BY10 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC46A2Q9BY10 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC46A2Q9BY10 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC46A2Q9BY10 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC46A2Q9BY10 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC46A2Q9BY10 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC46A2Q9BY10 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC46A2Q9BY10 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC46A2Q9BY10 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC46A2Q9BY10 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC46A2Q9BY10 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC46A2Q9BY10 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC46A2Q9BY10 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC46A2Q9BY10 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC46A2Q9BY10 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC46A2Q9BY10 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC46A2Q9BY10 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC46A2Q9BY10 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC46A2Q9BY10 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC46A2Q9BY10 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC46A2Q9BY10 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC46A2Q9BY10 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC46A2Q9BY10 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC46A2Q9BY10 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC46A2Q9BY10 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms