Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RSPO3Q9BXY4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms