Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BBS2Q9BXC9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BBS2Q9BXC9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BBS2Q9BXC9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BBS2Q9BXC9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BBS2Q9BXC9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BBS2Q9BXC9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BBS2Q9BXC9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BBS2Q9BXC9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BBS2Q9BXC9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BBS2Q9BXC9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BBS2Q9BXC9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BBS2Q9BXC9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BBS2Q9BXC9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
BBS2Q9BXC9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BBS2Q9BXC9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BBS2Q9BXC9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BBS2Q9BXC9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BBS2Q9BXC9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBS2Q9BXC9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBS2Q9BXC9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBS2Q9BXC9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBS2Q9BXC9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBS2Q9BXC9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBS2Q9BXC9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBS2Q9BXC9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
BBS2Q9BXC9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBS2Q9BXC9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBS2Q9BXC9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBS2Q9BXC9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBS2Q9BXC9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBS2Q9BXC9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBS2Q9BXC9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBS2Q9BXC9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBS2Q9BXC9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBS2Q9BXC9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBS2Q9BXC9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBS2Q9BXC9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBS2Q9BXC9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBS2Q9BXC9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBS2Q9BXC9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBS2Q9BXC9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBS2Q9BXC9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBS2Q9BXC9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBS2Q9BXC9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BBS2Q9BXC9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBS2Q9BXC9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BBS2Q9BXC9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BBS2Q9BXC9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BBS2Q9BXC9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BBS2Q9BXC9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BBS2Q9BXC9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BBS2Q9BXC9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BBS2Q9BXC9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BBS2Q9BXC9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms