Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IFT27Q9BW83 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms