Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW11

MXD3, Max dimerization protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXD3Q9BW11 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MXD3Q9BW11 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MXD3Q9BW11 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MXD3Q9BW11 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MXD3Q9BW11 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MXD3Q9BW11 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MXD3Q9BW11 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MXD3Q9BW11 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MXD3Q9BW11 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MXD3Q9BW11 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MXD3Q9BW11 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MXD3Q9BW11 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MXD3Q9BW11 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MXD3Q9BW11 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
MXD3Q9BW11 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MXD3Q9BW11 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
MXD3Q9BW11 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MXD3Q9BW11 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MXD3Q9BW11 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MXD3Q9BW11 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MXD3Q9BW11 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MXD3Q9BW11 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MXD3Q9BW11 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MXD3Q9BW11 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MXD3Q9BW11 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
MXD3Q9BW11 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MXD3Q9BW11 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MXD3Q9BW11 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MXD3Q9BW11 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MXD3Q9BW11 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MXD3Q9BW11 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
MXD3Q9BW11 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MXD3Q9BW11 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MXD3Q9BW11 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MXD3Q9BW11 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MXD3Q9BW11 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MXD3Q9BW11 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms