Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIOK2Q9BVS4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RIOK2Q9BVS4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIOK2Q9BVS4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIOK2Q9BVS4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIOK2Q9BVS4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIOK2Q9BVS4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIOK2Q9BVS4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIOK2Q9BVS4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIOK2Q9BVS4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RIOK2Q9BVS4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIOK2Q9BVS4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RIOK2Q9BVS4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RIOK2Q9BVS4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIOK2Q9BVS4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RIOK2Q9BVS4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RIOK2Q9BVS4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIOK2Q9BVS4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIOK2Q9BVS4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIOK2Q9BVS4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIOK2Q9BVS4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIOK2Q9BVS4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIOK2Q9BVS4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIOK2Q9BVS4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIOK2Q9BVS4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIOK2Q9BVS4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIOK2Q9BVS4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIOK2Q9BVS4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIOK2Q9BVS4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIOK2Q9BVS4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIOK2Q9BVS4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIOK2Q9BVS4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIOK2Q9BVS4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIOK2Q9BVS4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIOK2Q9BVS4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIOK2Q9BVS4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RIOK2Q9BVS4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIOK2Q9BVS4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RIOK2Q9BVS4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RIOK2Q9BVS4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIOK2Q9BVS4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIOK2Q9BVS4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIOK2Q9BVS4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIOK2Q9BVS4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIOK2Q9BVS4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIOK2Q9BVS4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIOK2Q9BVS4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIOK2Q9BVS4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RIOK2Q9BVS4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIOK2Q9BVS4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIOK2Q9BVS4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
RIOK2Q9BVS4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIOK2Q9BVS4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIOK2Q9BVS4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIOK2Q9BVS4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIOK2Q9BVS4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms