Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUV0

RSRP1, Arginine/serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSRP1Q9BUV0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RSRP1Q9BUV0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RSRP1Q9BUV0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RSRP1Q9BUV0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RSRP1Q9BUV0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RSRP1Q9BUV0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RSRP1Q9BUV0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RSRP1Q9BUV0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RSRP1Q9BUV0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RSRP1Q9BUV0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RSRP1Q9BUV0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
RSRP1Q9BUV0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RSRP1Q9BUV0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RSRP1Q9BUV0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RSRP1Q9BUV0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RSRP1Q9BUV0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RSRP1Q9BUV0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RSRP1Q9BUV0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RSRP1Q9BUV0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RSRP1Q9BUV0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RSRP1Q9BUV0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RSRP1Q9BUV0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RSRP1Q9BUV0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RSRP1Q9BUV0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RSRP1Q9BUV0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RSRP1Q9BUV0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RSRP1Q9BUV0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
RSRP1Q9BUV0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms