Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF7

CRB3, Protein crumbs homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB3Q9BUF7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB3Q9BUF7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms