Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CRACR2AQ9BSW2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CRACR2AQ9BSW2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRACR2AQ9BSW2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRACR2AQ9BSW2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRACR2AQ9BSW2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CRACR2AQ9BSW2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRACR2AQ9BSW2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRACR2AQ9BSW2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRACR2AQ9BSW2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRACR2AQ9BSW2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRACR2AQ9BSW2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRACR2AQ9BSW2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRACR2AQ9BSW2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRACR2AQ9BSW2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRACR2AQ9BSW2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRACR2AQ9BSW2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRACR2AQ9BSW2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRACR2AQ9BSW2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRACR2AQ9BSW2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRACR2AQ9BSW2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRACR2AQ9BSW2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRACR2AQ9BSW2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRACR2AQ9BSW2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRACR2AQ9BSW2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRACR2AQ9BSW2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRACR2AQ9BSW2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRACR2AQ9BSW2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRACR2AQ9BSW2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRACR2AQ9BSW2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRACR2AQ9BSW2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRACR2AQ9BSW2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRACR2AQ9BSW2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CRACR2AQ9BSW2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRACR2AQ9BSW2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRACR2AQ9BSW2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRACR2AQ9BSW2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRACR2AQ9BSW2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRACR2AQ9BSW2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms