Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 280.4 ms