Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIKE1Q9BRV8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms