Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
FYCO1Q9BQS8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC37.49■■■■□ 3.59
FYCO1Q9BQS8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
FYCO1Q9BQS8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
FYCO1Q9BQS8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
FYCO1Q9BQS8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
FYCO1Q9BQS8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
FYCO1Q9BQS8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
FYCO1Q9BQS8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
FYCO1Q9BQS8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
FYCO1Q9BQS8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
FYCO1Q9BQS8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
FYCO1Q9BQS8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
FYCO1Q9BQS8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
FYCO1Q9BQS8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
FYCO1Q9BQS8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
FYCO1Q9BQS8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
FYCO1Q9BQS8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
FYCO1Q9BQS8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
FYCO1Q9BQS8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
FYCO1Q9BQS8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
FYCO1Q9BQS8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
FYCO1Q9BQS8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC37.44■■■■□ 3.58
FYCO1Q9BQS8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
FYCO1Q9BQS8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
FYCO1Q9BQS8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
FYCO1Q9BQS8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
FYCO1Q9BQS8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
FYCO1Q9BQS8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
FYCO1Q9BQS8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC37.42■■■■□ 3.58
FYCO1Q9BQS8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
FYCO1Q9BQS8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
FYCO1Q9BQS8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
FYCO1Q9BQS8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
FYCO1Q9BQS8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
FYCO1Q9BQS8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
FYCO1Q9BQS8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
FYCO1Q9BQS8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
FYCO1Q9BQS8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
FYCO1Q9BQS8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
FYCO1Q9BQS8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
FYCO1Q9BQS8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
FYCO1Q9BQS8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
FYCO1Q9BQS8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
FYCO1Q9BQS8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
FYCO1Q9BQS8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
FYCO1Q9BQS8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
FYCO1Q9BQS8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
FYCO1Q9BQS8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
FYCO1Q9BQS8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
FYCO1Q9BQS8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC37.38■■■■□ 3.57
FYCO1Q9BQS8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
FYCO1Q9BQS8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
FYCO1Q9BQS8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
FYCO1Q9BQS8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
FYCO1Q9BQS8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
FYCO1Q9BQS8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
FYCO1Q9BQS8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
FYCO1Q9BQS8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
FYCO1Q9BQS8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
FYCO1Q9BQS8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
FYCO1Q9BQS8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
FYCO1Q9BQS8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
FYCO1Q9BQS8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
FYCO1Q9BQS8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
FYCO1Q9BQS8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
FYCO1Q9BQS8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
FYCO1Q9BQS8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
FYCO1Q9BQS8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
FYCO1Q9BQS8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
FYCO1Q9BQS8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
FYCO1Q9BQS8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
FYCO1Q9BQS8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
FYCO1Q9BQS8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC37.32■■■■□ 3.56
FYCO1Q9BQS8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
FYCO1Q9BQS8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
FYCO1Q9BQS8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
FYCO1Q9BQS8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
FYCO1Q9BQS8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
FYCO1Q9BQS8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
FYCO1Q9BQS8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
FYCO1Q9BQS8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
FYCO1Q9BQS8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
FYCO1Q9BQS8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
FYCO1Q9BQS8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
FYCO1Q9BQS8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
FYCO1Q9BQS8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
FYCO1Q9BQS8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
FYCO1Q9BQS8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
FYCO1Q9BQS8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC37.27■■■■□ 3.56
FYCO1Q9BQS8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
FYCO1Q9BQS8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
FYCO1Q9BQS8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
FYCO1Q9BQS8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
FYCO1Q9BQS8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
FYCO1Q9BQS8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
FYCO1Q9BQS8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
FYCO1Q9BQS8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
FYCO1Q9BQS8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
FYCO1Q9BQS8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms