Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQG1

SYT3, Synaptotagmin-3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT3Q9BQG1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT3Q9BQG1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms