Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms