Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPX3

NCAPG, Condensin complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPGQ9BPX3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCAPGQ9BPX3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NCAPGQ9BPX3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCAPGQ9BPX3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCAPGQ9BPX3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCAPGQ9BPX3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCAPGQ9BPX3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCAPGQ9BPX3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCAPGQ9BPX3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NCAPGQ9BPX3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NCAPGQ9BPX3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCAPGQ9BPX3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NCAPGQ9BPX3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NCAPGQ9BPX3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCAPGQ9BPX3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NCAPGQ9BPX3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCAPGQ9BPX3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCAPGQ9BPX3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCAPGQ9BPX3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCAPGQ9BPX3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCAPGQ9BPX3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCAPGQ9BPX3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCAPGQ9BPX3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCAPGQ9BPX3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NCAPGQ9BPX3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCAPGQ9BPX3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCAPGQ9BPX3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCAPGQ9BPX3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCAPGQ9BPX3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCAPGQ9BPX3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCAPGQ9BPX3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCAPGQ9BPX3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCAPGQ9BPX3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCAPGQ9BPX3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCAPGQ9BPX3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCAPGQ9BPX3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCAPGQ9BPX3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCAPGQ9BPX3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms