Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP2Q99959 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP2Q99959 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP2Q99959 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP2Q99959 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP2Q99959 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP2Q99959 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP2Q99959 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP2Q99959 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP2Q99959 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP2Q99959 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP2Q99959 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP2Q99959 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP2Q99959 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP2Q99959 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP2Q99959 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP2Q99959 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP2Q99959 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP2Q99959 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP2Q99959 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP2Q99959 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKP2Q99959 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKP2Q99959 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKP2Q99959 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKP2Q99959 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKP2Q99959 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP2Q99959 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP2Q99959 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP2Q99959 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP2Q99959 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP2Q99959 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP2Q99959 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP2Q99959 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP2Q99959 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP2Q99959 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP2Q99959 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP2Q99959 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP2Q99959 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP2Q99959 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP2Q99959 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP2Q99959 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP2Q99959 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms