Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SORT1Q99523 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SORT1Q99523 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SORT1Q99523 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SORT1Q99523 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SORT1Q99523 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SORT1Q99523 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SORT1Q99523 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SORT1Q99523 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SORT1Q99523 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SORT1Q99523 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SORT1Q99523 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SORT1Q99523 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SORT1Q99523 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SORT1Q99523 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SORT1Q99523 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SORT1Q99523 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SORT1Q99523 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms