Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NAP1L3Q99457 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NAP1L3Q99457 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NAP1L3Q99457 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NAP1L3Q99457 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NAP1L3Q99457 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NAP1L3Q99457 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NAP1L3Q99457 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NAP1L3Q99457 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NAP1L3Q99457 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NAP1L3Q99457 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NAP1L3Q99457 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NAP1L3Q99457 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NAP1L3Q99457 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NAP1L3Q99457 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NAP1L3Q99457 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NAP1L3Q99457 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NAP1L3Q99457 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NAP1L3Q99457 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NAP1L3Q99457 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NAP1L3Q99457 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NAP1L3Q99457 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NAP1L3Q99457 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NAP1L3Q99457 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NAP1L3Q99457 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NAP1L3Q99457 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NAP1L3Q99457 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NAP1L3Q99457 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NAP1L3Q99457 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NAP1L3Q99457 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NAP1L3Q99457 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NAP1L3Q99457 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NAP1L3Q99457 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NAP1L3Q99457 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NAP1L3Q99457 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NAP1L3Q99457 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NAP1L3Q99457 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NAP1L3Q99457 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NAP1L3Q99457 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NAP1L3Q99457 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NAP1L3Q99457 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NAP1L3Q99457 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NAP1L3Q99457 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NAP1L3Q99457 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NAP1L3Q99457 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NAP1L3Q99457 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NAP1L3Q99457 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NAP1L3Q99457 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NAP1L3Q99457 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms