Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YME1L1Q96TA2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
YME1L1Q96TA2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YME1L1Q96TA2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YME1L1Q96TA2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YME1L1Q96TA2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
YME1L1Q96TA2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
YME1L1Q96TA2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YME1L1Q96TA2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
YME1L1Q96TA2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YME1L1Q96TA2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YME1L1Q96TA2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YME1L1Q96TA2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YME1L1Q96TA2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YME1L1Q96TA2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YME1L1Q96TA2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YME1L1Q96TA2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YME1L1Q96TA2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YME1L1Q96TA2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YME1L1Q96TA2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
YME1L1Q96TA2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
YME1L1Q96TA2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
YME1L1Q96TA2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YME1L1Q96TA2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YME1L1Q96TA2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
YME1L1Q96TA2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YME1L1Q96TA2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
YME1L1Q96TA2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YME1L1Q96TA2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YME1L1Q96TA2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
YME1L1Q96TA2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
YME1L1Q96TA2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
YME1L1Q96TA2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
YME1L1Q96TA2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
YME1L1Q96TA2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
YME1L1Q96TA2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
YME1L1Q96TA2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
YME1L1Q96TA2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
YME1L1Q96TA2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
YME1L1Q96TA2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
YME1L1Q96TA2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
YME1L1Q96TA2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
YME1L1Q96TA2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
YME1L1Q96TA2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
YME1L1Q96TA2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
YME1L1Q96TA2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YME1L1Q96TA2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
YME1L1Q96TA2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
YME1L1Q96TA2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
YME1L1Q96TA2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
YME1L1Q96TA2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
YME1L1Q96TA2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
YME1L1Q96TA2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
YME1L1Q96TA2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
YME1L1Q96TA2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
YME1L1Q96TA2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
YME1L1Q96TA2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
YME1L1Q96TA2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
YME1L1Q96TA2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
YME1L1Q96TA2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
YME1L1Q96TA2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
YME1L1Q96TA2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
YME1L1Q96TA2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
YME1L1Q96TA2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
YME1L1Q96TA2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
YME1L1Q96TA2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
YME1L1Q96TA2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
YME1L1Q96TA2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
YME1L1Q96TA2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
YME1L1Q96TA2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
YME1L1Q96TA2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
YME1L1Q96TA2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
YME1L1Q96TA2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
YME1L1Q96TA2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
YME1L1Q96TA2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
YME1L1Q96TA2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
YME1L1Q96TA2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
YME1L1Q96TA2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YME1L1Q96TA2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YME1L1Q96TA2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
YME1L1Q96TA2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YME1L1Q96TA2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YME1L1Q96TA2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
YME1L1Q96TA2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
YME1L1Q96TA2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
YME1L1Q96TA2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
YME1L1Q96TA2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
YME1L1Q96TA2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
YME1L1Q96TA2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
YME1L1Q96TA2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
YME1L1Q96TA2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
YME1L1Q96TA2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
YME1L1Q96TA2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
YME1L1Q96TA2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
YME1L1Q96TA2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
YME1L1Q96TA2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
YME1L1Q96TA2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
YME1L1Q96TA2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
YME1L1Q96TA2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
YME1L1Q96TA2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms