Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC43.06■■■■■ 4.48
RSF1Q96T23 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
RSF1Q96T23 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC43.05■■■■■ 4.48
RSF1Q96T23 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC43.05■■■■■ 4.48
RSF1Q96T23 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.04■■■■■ 4.48
RSF1Q96T23 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
RSF1Q96T23 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
RSF1Q96T23 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
RSF1Q96T23 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC43.03■■■■■ 4.48
RSF1Q96T23 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC43.03■■■■■ 4.48
RSF1Q96T23 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
RSF1Q96T23 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
RSF1Q96T23 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
RSF1Q96T23 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
RSF1Q96T23 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC43.01■■■■■ 4.48
RSF1Q96T23 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC43.01■■■■■ 4.48
RSF1Q96T23 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC43.01■■■■■ 4.48
RSF1Q96T23 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC43■■■■■ 4.47
RSF1Q96T23 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC43■■■■■ 4.47
RSF1Q96T23 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
RSF1Q96T23 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC42.98■■■■■ 4.47
RSF1Q96T23 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC42.98■■■■■ 4.47
RSF1Q96T23 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
RSF1Q96T23 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC42.98■■■■■ 4.47
RSF1Q96T23 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
RSF1Q96T23 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC42.97■■■■■ 4.47
RSF1Q96T23 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.96■■■■■ 4.47
RSF1Q96T23 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
RSF1Q96T23 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC42.96■■■■■ 4.47
RSF1Q96T23 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
RSF1Q96T23 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
RSF1Q96T23 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
RSF1Q96T23 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC42.95■■■■■ 4.47
RSF1Q96T23 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.95■■■■■ 4.47
RSF1Q96T23 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.47
RSF1Q96T23 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC42.94■■■■■ 4.46
RSF1Q96T23 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.94■■■■■ 4.46
RSF1Q96T23 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC42.94■■■■■ 4.46
RSF1Q96T23 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
RSF1Q96T23 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
RSF1Q96T23 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
RSF1Q96T23 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
RSF1Q96T23 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
RSF1Q96T23 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC42.91■■■■■ 4.46
RSF1Q96T23 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
RSF1Q96T23 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
RSF1Q96T23 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
RSF1Q96T23 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC42.9■■■■■ 4.46
RSF1Q96T23 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
RSF1Q96T23 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC42.9■■■■■ 4.46
RSF1Q96T23 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
RSF1Q96T23 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC42.89■■■■■ 4.46
RSF1Q96T23 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC42.89■■■■■ 4.46
RSF1Q96T23 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC42.89■■■■■ 4.46
RSF1Q96T23 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC42.89■■■■■ 4.46
RSF1Q96T23 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
RSF1Q96T23 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
RSF1Q96T23 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
RSF1Q96T23 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
RSF1Q96T23 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
RSF1Q96T23 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
RSF1Q96T23 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
RSF1Q96T23 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
RSF1Q96T23 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC42.87■■■■■ 4.45
RSF1Q96T23 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.87■■■■■ 4.45
RSF1Q96T23 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
RSF1Q96T23 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
RSF1Q96T23 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
RSF1Q96T23 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
RSF1Q96T23 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
RSF1Q96T23 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC42.86■■■■■ 4.45
RSF1Q96T23 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC42.86■■■■■ 4.45
RSF1Q96T23 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
RSF1Q96T23 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
RSF1Q96T23 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC42.85■■■■■ 4.45
RSF1Q96T23 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
RSF1Q96T23 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC42.84■■■■■ 4.45
RSF1Q96T23 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC42.84■■■■■ 4.45
RSF1Q96T23 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC42.84■■■■■ 4.45
RSF1Q96T23 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.84■■■■■ 4.45
RSF1Q96T23 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC42.84■■■■■ 4.45
RSF1Q96T23 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC42.84■■■■■ 4.45
RSF1Q96T23 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
RSF1Q96T23 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
RSF1Q96T23 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC42.83■■■■■ 4.45
RSF1Q96T23 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.83■■■■■ 4.45
RSF1Q96T23 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
RSF1Q96T23 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
RSF1Q96T23 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
RSF1Q96T23 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.45
RSF1Q96T23 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
RSF1Q96T23 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
RSF1Q96T23 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
RSF1Q96T23 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.45
RSF1Q96T23 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
RSF1Q96T23 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.81■■■■■ 4.44
RSF1Q96T23 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC42.81■■■■■ 4.44
RSF1Q96T23 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.81■■■■■ 4.44
RSF1Q96T23 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
RSF1Q96T23 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms