Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CSRNP1Q96S65 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CSRNP1Q96S65 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CSRNP1Q96S65 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CSRNP1Q96S65 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CSRNP1Q96S65 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
CSRNP1Q96S65 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CSRNP1Q96S65 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSRNP1Q96S65 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSRNP1Q96S65 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSRNP1Q96S65 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSRNP1Q96S65 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSRNP1Q96S65 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSRNP1Q96S65 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSRNP1Q96S65 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSRNP1Q96S65 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSRNP1Q96S65 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSRNP1Q96S65 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CSRNP1Q96S65 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSRNP1Q96S65 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSRNP1Q96S65 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSRNP1Q96S65 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSRNP1Q96S65 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSRNP1Q96S65 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSRNP1Q96S65 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSRNP1Q96S65 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSRNP1Q96S65 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSRNP1Q96S65 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSRNP1Q96S65 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSRNP1Q96S65 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSRNP1Q96S65 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CSRNP1Q96S65 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSRNP1Q96S65 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSRNP1Q96S65 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSRNP1Q96S65 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSRNP1Q96S65 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSRNP1Q96S65 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSRNP1Q96S65 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSRNP1Q96S65 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSRNP1Q96S65 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CSRNP1Q96S65 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CSRNP1Q96S65 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CSRNP1Q96S65 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CSRNP1Q96S65 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSRNP1Q96S65 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSRNP1Q96S65 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSRNP1Q96S65 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CSRNP1Q96S65 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSRNP1Q96S65 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSRNP1Q96S65 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSRNP1Q96S65 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CSRNP1Q96S65 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CSRNP1Q96S65 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CSRNP1Q96S65 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CSRNP1Q96S65 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CSRNP1Q96S65 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CSRNP1Q96S65 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms