Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC85AQ96PX6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC85AQ96PX6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC85AQ96PX6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC85AQ96PX6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC85AQ96PX6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC85AQ96PX6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC85AQ96PX6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC85AQ96PX6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC85AQ96PX6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC85AQ96PX6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC85AQ96PX6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC85AQ96PX6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC85AQ96PX6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC85AQ96PX6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC85AQ96PX6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC85AQ96PX6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC85AQ96PX6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC85AQ96PX6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC85AQ96PX6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC85AQ96PX6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC85AQ96PX6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC85AQ96PX6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC85AQ96PX6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC85AQ96PX6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC85AQ96PX6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC85AQ96PX6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC85AQ96PX6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC85AQ96PX6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC85AQ96PX6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC85AQ96PX6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC85AQ96PX6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC85AQ96PX6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC85AQ96PX6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC85AQ96PX6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC85AQ96PX6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC85AQ96PX6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC85AQ96PX6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC85AQ96PX6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC85AQ96PX6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC85AQ96PX6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC85AQ96PX6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC85AQ96PX6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC85AQ96PX6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC85AQ96PX6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC85AQ96PX6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC85AQ96PX6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC85AQ96PX6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC85AQ96PX6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC85AQ96PX6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC85AQ96PX6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC85AQ96PX6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC85AQ96PX6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC85AQ96PX6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC85AQ96PX6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC85AQ96PX6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC85AQ96PX6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC85AQ96PX6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC85AQ96PX6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC85AQ96PX6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC85AQ96PX6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC85AQ96PX6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC85AQ96PX6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC85AQ96PX6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC85AQ96PX6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC85AQ96PX6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC85AQ96PX6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC85AQ96PX6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC85AQ96PX6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC85AQ96PX6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC85AQ96PX6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC85AQ96PX6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC85AQ96PX6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC85AQ96PX6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC85AQ96PX6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC85AQ96PX6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC85AQ96PX6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC85AQ96PX6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC85AQ96PX6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC85AQ96PX6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC85AQ96PX6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC85AQ96PX6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC85AQ96PX6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC85AQ96PX6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC85AQ96PX6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC85AQ96PX6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC85AQ96PX6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC85AQ96PX6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC85AQ96PX6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC85AQ96PX6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC85AQ96PX6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC85AQ96PX6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC85AQ96PX6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC85AQ96PX6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC85AQ96PX6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC85AQ96PX6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC85AQ96PX6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC85AQ96PX6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC85AQ96PX6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC85AQ96PX6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms