Protein–RNA interactions for Protein: Q96PD5

PGLYRP2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP2Q96PD5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PGLYRP2Q96PD5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PGLYRP2Q96PD5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGLYRP2Q96PD5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGLYRP2Q96PD5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGLYRP2Q96PD5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGLYRP2Q96PD5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PGLYRP2Q96PD5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGLYRP2Q96PD5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGLYRP2Q96PD5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGLYRP2Q96PD5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGLYRP2Q96PD5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGLYRP2Q96PD5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGLYRP2Q96PD5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGLYRP2Q96PD5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGLYRP2Q96PD5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGLYRP2Q96PD5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGLYRP2Q96PD5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGLYRP2Q96PD5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGLYRP2Q96PD5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGLYRP2Q96PD5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGLYRP2Q96PD5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGLYRP2Q96PD5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGLYRP2Q96PD5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGLYRP2Q96PD5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGLYRP2Q96PD5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGLYRP2Q96PD5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGLYRP2Q96PD5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGLYRP2Q96PD5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGLYRP2Q96PD5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PGLYRP2Q96PD5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PGLYRP2Q96PD5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGLYRP2Q96PD5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGLYRP2Q96PD5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGLYRP2Q96PD5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGLYRP2Q96PD5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PGLYRP2Q96PD5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGLYRP2Q96PD5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGLYRP2Q96PD5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGLYRP2Q96PD5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGLYRP2Q96PD5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGLYRP2Q96PD5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGLYRP2Q96PD5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGLYRP2Q96PD5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGLYRP2Q96PD5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGLYRP2Q96PD5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGLYRP2Q96PD5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PGLYRP2Q96PD5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGLYRP2Q96PD5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGLYRP2Q96PD5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGLYRP2Q96PD5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGLYRP2Q96PD5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGLYRP2Q96PD5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PGLYRP2Q96PD5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms