Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NLRP3Q96P20 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NLRP3Q96P20 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
NLRP3Q96P20 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NLRP3Q96P20 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NLRP3Q96P20 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NLRP3Q96P20 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NLRP3Q96P20 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NLRP3Q96P20 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NLRP3Q96P20 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NLRP3Q96P20 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
NLRP3Q96P20 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NLRP3Q96P20 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NLRP3Q96P20 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NLRP3Q96P20 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NLRP3Q96P20 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NLRP3Q96P20 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NLRP3Q96P20 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
NLRP3Q96P20 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NLRP3Q96P20 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NLRP3Q96P20 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NLRP3Q96P20 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NLRP3Q96P20 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NLRP3Q96P20 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NLRP3Q96P20 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NLRP3Q96P20 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NLRP3Q96P20 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NLRP3Q96P20 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NLRP3Q96P20 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NLRP3Q96P20 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NLRP3Q96P20 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NLRP3Q96P20 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NLRP3Q96P20 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NLRP3Q96P20 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NLRP3Q96P20 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NLRP3Q96P20 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NLRP3Q96P20 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NLRP3Q96P20 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NLRP3Q96P20 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NLRP3Q96P20 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NLRP3Q96P20 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NLRP3Q96P20 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NLRP3Q96P20 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NLRP3Q96P20 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NLRP3Q96P20 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NLRP3Q96P20 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NLRP3Q96P20 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NLRP3Q96P20 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
NLRP3Q96P20 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NLRP3Q96P20 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NLRP3Q96P20 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NLRP3Q96P20 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NLRP3Q96P20 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NLRP3Q96P20 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NLRP3Q96P20 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NLRP3Q96P20 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NLRP3Q96P20 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NLRP3Q96P20 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NLRP3Q96P20 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NLRP3Q96P20 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NLRP3Q96P20 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NLRP3Q96P20 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
NLRP3Q96P20 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
NLRP3Q96P20 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
NLRP3Q96P20 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
NLRP3Q96P20 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NLRP3Q96P20 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
NLRP3Q96P20 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
NLRP3Q96P20 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
NLRP3Q96P20 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NLRP3Q96P20 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NLRP3Q96P20 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NLRP3Q96P20 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NLRP3Q96P20 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NLRP3Q96P20 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NLRP3Q96P20 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NLRP3Q96P20 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NLRP3Q96P20 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NLRP3Q96P20 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
NLRP3Q96P20 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NLRP3Q96P20 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NLRP3Q96P20 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NLRP3Q96P20 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
NLRP3Q96P20 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NLRP3Q96P20 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NLRP3Q96P20 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
NLRP3Q96P20 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
NLRP3Q96P20 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NLRP3Q96P20 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NLRP3Q96P20 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NLRP3Q96P20 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NLRP3Q96P20 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NLRP3Q96P20 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NLRP3Q96P20 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NLRP3Q96P20 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NLRP3Q96P20 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NLRP3Q96P20 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NLRP3Q96P20 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NLRP3Q96P20 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NLRP3Q96P20 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms