Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUNDC3BQ96NL0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUNDC3BQ96NL0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUNDC3BQ96NL0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RUNDC3BQ96NL0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUNDC3BQ96NL0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUNDC3BQ96NL0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUNDC3BQ96NL0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNDC3BQ96NL0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNDC3BQ96NL0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNDC3BQ96NL0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNDC3BQ96NL0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNDC3BQ96NL0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNDC3BQ96NL0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNDC3BQ96NL0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNDC3BQ96NL0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNDC3BQ96NL0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNDC3BQ96NL0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNDC3BQ96NL0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNDC3BQ96NL0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNDC3BQ96NL0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNDC3BQ96NL0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNDC3BQ96NL0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNDC3BQ96NL0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNDC3BQ96NL0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUNDC3BQ96NL0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUNDC3BQ96NL0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUNDC3BQ96NL0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RUNDC3BQ96NL0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUNDC3BQ96NL0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUNDC3BQ96NL0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUNDC3BQ96NL0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUNDC3BQ96NL0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RUNDC3BQ96NL0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUNDC3BQ96NL0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUNDC3BQ96NL0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUNDC3BQ96NL0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUNDC3BQ96NL0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUNDC3BQ96NL0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RUNDC3BQ96NL0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUNDC3BQ96NL0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUNDC3BQ96NL0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RUNDC3BQ96NL0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUNDC3BQ96NL0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUNDC3BQ96NL0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUNDC3BQ96NL0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUNDC3BQ96NL0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUNDC3BQ96NL0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUNDC3BQ96NL0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUNDC3BQ96NL0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUNDC3BQ96NL0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUNDC3BQ96NL0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUNDC3BQ96NL0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUNDC3BQ96NL0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUNDC3BQ96NL0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUNDC3BQ96NL0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUNDC3BQ96NL0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUNDC3BQ96NL0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUNDC3BQ96NL0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RUNDC3BQ96NL0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUNDC3BQ96NL0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUNDC3BQ96NL0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUNDC3BQ96NL0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUNDC3BQ96NL0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUNDC3BQ96NL0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUNDC3BQ96NL0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUNDC3BQ96NL0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUNDC3BQ96NL0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RUNDC3BQ96NL0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUNDC3BQ96NL0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUNDC3BQ96NL0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUNDC3BQ96NL0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUNDC3BQ96NL0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms