Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSNARE1Q96NA8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSNARE1Q96NA8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.1 ms