Protein–RNA interactions for Protein: Q96N58

ZNF578, Zinc finger protein 578, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF578Q96N58 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF578Q96N58 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF578Q96N58 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF578Q96N58 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF578Q96N58 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF578Q96N58 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF578Q96N58 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF578Q96N58 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF578Q96N58 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF578Q96N58 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF578Q96N58 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF578Q96N58 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF578Q96N58 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms