Protein–RNA interactions for Protein: Q96N28

PRELID3A, PRELI domain containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3AQ96N28 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRELID3AQ96N28 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRELID3AQ96N28 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRELID3AQ96N28 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRELID3AQ96N28 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRELID3AQ96N28 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRELID3AQ96N28 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRELID3AQ96N28 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRELID3AQ96N28 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRELID3AQ96N28 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRELID3AQ96N28 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRELID3AQ96N28 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRELID3AQ96N28 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRELID3AQ96N28 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRELID3AQ96N28 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRELID3AQ96N28 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRELID3AQ96N28 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRELID3AQ96N28 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRELID3AQ96N28 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRELID3AQ96N28 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRELID3AQ96N28 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRELID3AQ96N28 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRELID3AQ96N28 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRELID3AQ96N28 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRELID3AQ96N28 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRELID3AQ96N28 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRELID3AQ96N28 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRELID3AQ96N28 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRELID3AQ96N28 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRELID3AQ96N28 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRELID3AQ96N28 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms