Protein–RNA interactions for Protein: Q96N03

VSTM2L, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2LQ96N03 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
VSTM2LQ96N03 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSTM2LQ96N03 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSTM2LQ96N03 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSTM2LQ96N03 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSTM2LQ96N03 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSTM2LQ96N03 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VSTM2LQ96N03 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSTM2LQ96N03 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSTM2LQ96N03 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VSTM2LQ96N03 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSTM2LQ96N03 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSTM2LQ96N03 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSTM2LQ96N03 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSTM2LQ96N03 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSTM2LQ96N03 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSTM2LQ96N03 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSTM2LQ96N03 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSTM2LQ96N03 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VSTM2LQ96N03 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VSTM2LQ96N03 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VSTM2LQ96N03 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VSTM2LQ96N03 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
VSTM2LQ96N03 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VSTM2LQ96N03 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VSTM2LQ96N03 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VSTM2LQ96N03 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VSTM2LQ96N03 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VSTM2LQ96N03 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VSTM2LQ96N03 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VSTM2LQ96N03 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms