Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC7Q96M83 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC7Q96M83 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC7Q96M83 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC7Q96M83 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC7Q96M83 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC7Q96M83 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC7Q96M83 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCDC7Q96M83 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCDC7Q96M83 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCDC7Q96M83 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCDC7Q96M83 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CCDC7Q96M83 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CCDC7Q96M83 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CCDC7Q96M83 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CCDC7Q96M83 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CCDC7Q96M83 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CCDC7Q96M83 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCDC7Q96M83 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCDC7Q96M83 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCDC7Q96M83 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCDC7Q96M83 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC7Q96M83 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC7Q96M83 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC7Q96M83 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC7Q96M83 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC7Q96M83 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC7Q96M83 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC7Q96M83 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC7Q96M83 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC7Q96M83 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC7Q96M83 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC7Q96M83 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC7Q96M83 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC7Q96M83 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC7Q96M83 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC7Q96M83 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC7Q96M83 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC7Q96M83 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC7Q96M83 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC7Q96M83 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC7Q96M83 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC7Q96M83 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC7Q96M83 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC7Q96M83 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC7Q96M83 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC7Q96M83 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CCDC7Q96M83 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CCDC7Q96M83 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CCDC7Q96M83 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC7Q96M83 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC7Q96M83 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC7Q96M83 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC7Q96M83 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC7Q96M83 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC7Q96M83 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC7Q96M83 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms