Protein–RNA interactions for Protein: Q96KA5

CLPTM1L, Cleft lip and palate transmembrane protein 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1LQ96KA5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLPTM1LQ96KA5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLPTM1LQ96KA5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms