Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
LRRIQ1Q96JM4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
LRRIQ1Q96JM4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
LRRIQ1Q96JM4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
LRRIQ1Q96JM4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
LRRIQ1Q96JM4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
LRRIQ1Q96JM4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
LRRIQ1Q96JM4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
LRRIQ1Q96JM4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
LRRIQ1Q96JM4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
LRRIQ1Q96JM4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
LRRIQ1Q96JM4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC37.41■■■■□ 3.58
LRRIQ1Q96JM4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
LRRIQ1Q96JM4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
LRRIQ1Q96JM4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
LRRIQ1Q96JM4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
LRRIQ1Q96JM4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
LRRIQ1Q96JM4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
LRRIQ1Q96JM4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
LRRIQ1Q96JM4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
LRRIQ1Q96JM4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
LRRIQ1Q96JM4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
LRRIQ1Q96JM4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
LRRIQ1Q96JM4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
LRRIQ1Q96JM4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
LRRIQ1Q96JM4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
LRRIQ1Q96JM4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
LRRIQ1Q96JM4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
LRRIQ1Q96JM4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
LRRIQ1Q96JM4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
LRRIQ1Q96JM4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
LRRIQ1Q96JM4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
LRRIQ1Q96JM4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
LRRIQ1Q96JM4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
LRRIQ1Q96JM4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
LRRIQ1Q96JM4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
LRRIQ1Q96JM4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
LRRIQ1Q96JM4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
LRRIQ1Q96JM4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
LRRIQ1Q96JM4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
LRRIQ1Q96JM4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
LRRIQ1Q96JM4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.57
LRRIQ1Q96JM4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
LRRIQ1Q96JM4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
LRRIQ1Q96JM4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
LRRIQ1Q96JM4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
LRRIQ1Q96JM4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
LRRIQ1Q96JM4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
LRRIQ1Q96JM4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
LRRIQ1Q96JM4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
LRRIQ1Q96JM4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
LRRIQ1Q96JM4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC37.3■■■■□ 3.56
LRRIQ1Q96JM4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
LRRIQ1Q96JM4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
LRRIQ1Q96JM4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
LRRIQ1Q96JM4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
LRRIQ1Q96JM4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
LRRIQ1Q96JM4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
LRRIQ1Q96JM4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
LRRIQ1Q96JM4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
LRRIQ1Q96JM4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
LRRIQ1Q96JM4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
LRRIQ1Q96JM4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
LRRIQ1Q96JM4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
LRRIQ1Q96JM4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
LRRIQ1Q96JM4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
LRRIQ1Q96JM4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC37.28■■■■□ 3.56
LRRIQ1Q96JM4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
LRRIQ1Q96JM4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
LRRIQ1Q96JM4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
LRRIQ1Q96JM4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
LRRIQ1Q96JM4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC37.27■■■■□ 3.56
LRRIQ1Q96JM4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
LRRIQ1Q96JM4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
LRRIQ1Q96JM4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
LRRIQ1Q96JM4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
LRRIQ1Q96JM4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
LRRIQ1Q96JM4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
LRRIQ1Q96JM4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
LRRIQ1Q96JM4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
LRRIQ1Q96JM4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
LRRIQ1Q96JM4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
LRRIQ1Q96JM4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
LRRIQ1Q96JM4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
LRRIQ1Q96JM4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
LRRIQ1Q96JM4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
LRRIQ1Q96JM4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
LRRIQ1Q96JM4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
LRRIQ1Q96JM4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
LRRIQ1Q96JM4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
LRRIQ1Q96JM4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
LRRIQ1Q96JM4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
LRRIQ1Q96JM4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
LRRIQ1Q96JM4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
LRRIQ1Q96JM4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
LRRIQ1Q96JM4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
LRRIQ1Q96JM4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC37.19■■■■□ 3.54
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